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就在潘兴盘算着如何能够破坏对方恢复生产计划的时候，一个不好的情况突然出现了。那些曾经跟着他出击的士兵中，不少人突然出现了发烧的状况。开始的时候发烧的人并不多，但是这种病似乎传播的很快，不少照顾同伴的士兵也陆续开始发烧，甚至去城中采买食物的士兵还将病毒传给了市民，很快在民众中间这种病也开始陆续出现了。
发烧伴随着食欲减退和淋巴肿大等症状，在军队和民众中间蔓延开来，病倒的人越来越多，短短的十几天时间，兵营里就有超过一成的人发起了高烧，而且情况还在快速蔓延，很快就连高级军官中也有人得了病。
军营中的军医都是外科高手，如果让他们医治枪伤做手术，都是非常拿手的，而如果让他们治疗传染病就无能为力了，为此潘兴不得不想城市中征集民间的内科医生。
按照中华帝国的分类方法，波士顿帝国的医生都属于华医体系，而这些华医最大的特点就是需要依靠中华帝国出现的抗生素类药品，一旦没有这些药品，他们的能力也有限，在这方面比之中医就要差远了。
中医在中华帝国属于保密的医学领域，所有学习中医的人都必须是华族人才可以，而那些白人别说不让他们学，就算让他们学习，由于文化背景的差异太大，对于这种高深的医学，他们也很难学得精华。
此时民间的医生也相当缺乏，因为由于民众的人口密度更大，体质比军人差了许多，在民间疾病的流行更快。现在波士顿帝国缺少药物，许多医生也只能给病人采取放血和冷水降温等物理疗法，算是尽人事听天命了。
现在的潘兴元帅哪儿有时间去管民众的死活，城内的不少医生很快被征集起来，到军营中给士兵们看病，但结果让他非常失望，这些医生表示没有抗生素药物，他们对这种病无能为力。潘兴元帅失望之余，还是召见了当地的第一名医阿兰德。
“我现在想要问问你，这到底是什么病”潘兴元帅焦急的问道。
阿兰德在屋子里来回踱了两圈道：“从病人的状况来看，这应该是鼠疫。”
“鼠疫那是什么病”对病理是个门外汉的潘兴没有听懂病的名字。
阿兰德叹了口气道：“按照民间的说法，就是黑死病。”
“什么黑死病”潘兴元帅惊得站了起来，对于这种可怕的疾病，他是有了解的，知道现在西大陆的许多恐怖传说都与黑死病有关。
阿兰德点点头道：“如果我们有足够的抗生素类药物，或许还能够控制疫情，但现在中华帝国早已断掉了我国的药品供应，我们根本就没有办法进行治疗。”
潘兴元帅皱着眉头坐回椅子上道：“为什么会有这种疾病，难道是中华军的什么阴谋”
阿兰德摇摇头道：“这个我也不确定，不过大战之中不少尸体来不及掩埋，任他们在空气中腐烂就很容易产生病毒，而病毒可以通过空气散播，瘟疫就很容易形成了，尤其是鼠疫，它们是可以通过吃死人肉的野鼠进行传播的。中华帝国的军队那里虽然也有可能出现疫情，但他们有着充足的抗生素储备，根本不是我们能够比拟的。”对于真正的医学知识，波士顿人也都是一知半解，因为中华帝国的限制，波士顿国内很少有真正在中华帝国学过医学的人，所以他们的能力相当有限。
潘兴叹气道：“难道就没有什么补救的方法吗我们不能控制这种瘟疫的蔓延”
阿兰德沉思了片刻，突然沉声道：“有，但是相当残忍，所要付出的代价也相当大。”
潘兴的眼中凶光一闪道：“顾不得那么多了，只要能够控制瘟疫，就是再大的代价也必须承受。”
数天之后，一场全城大搜捕就开始了，所有开始发烧的人都被集中到了南城的贫民窟一带，那里已经被完全清空了，城区四周拉起了五道铁丝网，地面撒上了生石灰，里面只进不出，进行严格的封锁。
患病的人都被送了进去，就连那些士兵和军官们也不例外，而送进去的人就再也没有能够活着出来。为了防止交叉感染，能够让自己多活些日子，那些病的较轻的人很快将死尸堆叠起来，进行焚烧消毒。很快城南的黑烟开始接连不断的冒了起来，烧焦的尸臭味全城都能够闻到。但是很快那些病症较轻的人不再满足于焚烧尸体，他们将那些重病无法移动的人也扔进了火堆。
在阵阵惨叫之中，城里的尸臭味更浓了，但病人在持续减少，城南可以腾出更多的地方容纳新的病人。那些烧死重症病人的人，也很快再也爬不动了，他们又被后来的轻患者焚烧而死。尽管这种方法相当残忍，但瘟疫真的被有效的控制住了，城内患病的人开始减少，人们的情绪也慢慢恢复过来。
见到隔离的方法有用，潘兴元帅立刻通知其他出现疫情的城市，也是用隔离的方法消灭疫情。达文波特的隔离持续了一个星期才见到效果，而见到效果的潘兴元帅再通知其他城市已经晚了。
许多城市尽管也极力为病患治疗，却因为方法不当，没有取得多大效果。很快先发病的人陆续出现了死亡，当全身紫黑的尸体出现在人们面前的时候，有些见识的人立刻认出了这就是让西大陆人闻风色变的黑死病。
当黑死病流行的传闻在坊间流传之后，所有的人都慌了，黑死病被称为绝症在此时的波士顿帝国是根本无法医治的，这种非常容易被传染的疾病，一旦被传染就很难治愈。
面对如此恐怖的疾病，不少人选择了逃离疫区，一些没有生病的民众开始携家带口的逃亡它地，等到当地驻军接到潘兴元帅的通知，开始设置隔离疫区的时候为时已晚，不少人已经逃走了，而他们会将这种可怕的疾病带往全国各地。
一场波及整个芝加哥工业区的鼠疫，毁